Se puede realizar de la siguiente forma:
/tool/fetch mode=sftp upload=yes address="182.68.12.35"port=22 user="usuario" password="password" src-path="/ruta/de/archivo-origen.rsc" dst-path="/ruta/de/archivo-destino.rsc" keep-result=yes
Donde se tienen los siguientes campos:
Es importante tener en consideración que en el servidor ( el router Mikrotik que recibirá los archivos ) el grupo al que pertenezca el user deberá tener al menos habilitado las Policies ssh, ftp y write.